Comparative analysis of epigenetic markers in plasma and tissue of patients with colorectal cancer

Abstract

Aim. The work is devoted to the development of less invasive tools for the colorectal cancer (CRC) screening. Methods. Q-PCR and methylation-specific PCR techniques were used in the current work. Results. We have shown that the levels of cell-free plasma DNA are higher in the CRC patients compared with the healthy donors (p < 0.01). Hypermethylation of APC, FHIT, LRRC3B and HIC1 genes was studied in the tumor and plasma samples of CRC patients. Two-stage verification for CRC screening was proposed. Conclusions. We proposed and tested a novel approach for CRC screening based on the determination of cell-free DNA and methylated DNA fragments in the plasma.Мета. Розробка менш інвазивних методик для скринінгу злоякісних пухлин товстого кишечника (CRC). Методи. Використано кількісну ПЛР і метил-специфічну ПЛР. Результати. Показано, що середнє значення концентрацій вільно циркулюючої ДНК у плазмі крові є статистично достовірно вищим у пацієнтів з CRC порівняно зі здоровими донорами (p < 0,01). Встановлено гіперметилювання генів APC, FHIT, LRRC3B і HIC1 у пухлинах та плазмі хворих на CRC. Висновки. Нами запропоновано і перевірено новітній підхід для скринінгу CRC, який базується на визначенні позаклітинної ДНК і метильованих фрагментів ДНК у плазмі.Цель. Разработка менее инвазивных методик для скрининга злокачественных опухолей толстого кишечника (CRC). Методы. Использована количественная ПЦР и метил-специфическая ПЦР. Результаты. Показано, что среднее значение свободно циркулирующей ДНК в плазме статистически достоверно выше у пациентов с CRC по сравнению со здоровыми донорами (p < 0,01). Установлено гиперметилирование генов APC, FHIT, LRRC3B и HIC1 в опухолях и плазме пациентов с CRC. Выводы. Нами предложен и проверен новейший подход для скрининга CRC, базирующийся на определении внеклеточной ДНК и метилированных фрагментов ДНК в плазме.