Теоретическое изучение низкочастотных колебаний макромолекул ДНК

Abstract

Исследованы колебания структурных элементов полинуклеотидной цепи относительно равновесной конформации двутяжевых ДНК. В рассмотрение включены относительные движения нуклеотидов, связанных попарно водородными связями, изгибания полинуклеотидных цепей и внутринуклеозидная подвижность. Выполнен анализ нормальных колебаний двутяжевой цепи и определена структура низкочастотного спектра колебаний ДНК. Используя теоретические результаты и их согласие с данными спектроскопии комбинационного рассеяния (КР), предложена интерпретация наблюдаемых особенностей в спектрах низкочастотных колебаний ДНК.Досліджено коливання структурних елементів полінуклеотидного ланцюга щодо рівноважної конформації двотяжової ДНК. У розгляд включено відносні рухи нуклеотидів, попарно зв’язаних водневими зв’язками, згинання полінуклеотідних ланцюгів і внутрішньонуклеозидна рухливість. Виконано аналіз нормальних коливань двотяжового ланцюга і визначено структуру низькочастотного спектра коливань ДНК. Використовуючи теоретичні результати та їхнє узгодження з даними спектроскопії комбінаційного розсіювання (КР), запропоновано інтерпретацію спостережуваних особливостей у спектрах низькочастотних коливань ДНК.The theoretical investigation of low-frequency dynamics of DNA macromolecules is theoretically studied taking into account the hydrogen bond stretching in base pairs, the backbone flexibility and intranucleoside mobility. The structure of low-frequency macro-molecule vibration spectrum is determined. Using the theoretical results obtained and their correlation with DNA Raman spectra the interpretation of the set of experimental data is presented.