Модель трехмерной структуры основной антигенной детерминанты белка gp120 HIVThailand

Abstract

С использованием данных спектроскопии ЯМР, опубликованных в литературе, построена модель трехмерной структуры основной антигенной детерминанты белка gp120 HIVThailand. Определены элементы ее вторичной структуры и конформации нерегулярных сегментов. Исследованы конформационные возможности фрагмента, формирующего иммунодоминантный эпитоп вируса. Полу­ченные результаты обсуждены вместе с известными данными о пространственной организации гомологичного участка белка gp120 HIVMNЗ використанням даних спектроскопії ЯМР, опублікованих у літератури побудовано модель тривимірної структури основ­ної антигенної детермінанти білка gp120 HIVThailand. Визначе­но елементи її вторинної структури і конформації нерегуляр­них сегментів. Досліджено конформаційні можливості фрагмента, який формує імунодомінантний епітоп вірусу. Отри­мані результати обговорюються разом з відомими даними щодо просторової організації гомологічної ділянки білка gp120 HIVMN3D structurl model for Hit; principal neutralizing determinant of the HIVThailand protein gp120 has been proposed on the basis of NMR spectroscopy data reported in literature. The elements of the protein secondary structure and conformations of the irregular segments have been determined. The conformational flexibility of a fragment forming the virus immunodominant epitope is studied. The results obtained are discussed conjointly with the data on the spatial structure of the HIVMN protein gp120 homologous site.