Молекулярно-філогенетичний аналіз видів роду Armillaria (Fr.) Staude (Physalacriaceae), виявлених в Україні

Abstract

Подробно описаны молекулярные характеристики украинских образцов видов рода Armillaria по результатам анализа PCR–RFLP и нуклеотидных последовательностей трех ДНК-регионов: IGS–1, ITS1–5.8S–ITS2 рДНК и фрагмента гена EF–1alpha. Проведен также филогенетический анализ идентифицированных видов с украинских образцов. Зафиксировано гетерогенность в последовательностях рДНК и обнаружено несколько новых профилей PCR-RFLP в каждом исследуемом регионе. На территории Украины идентифицированы шесть видов рода Armillaria: A. borealis, A. cepistipes, A. ostoyae, A. mellea, A. gallica и A. tabescens.Molecular-based characterization of Armillaria species from Ukrainian specimens was accomplished. PCR-RFLP profiles and sequences of three DNA regions: IGS-1, ITS1-5.8S-ITS2 and fragment of EF-1alpha gene were investigated. We have detected heterogeneity in rDNA region and discovered a few new PCR-RFLP profiles in each of investigated DNA region. Phylogenetic analysis of identified Armillaria species from Ukraine based on sequences results was performed. According to this study, six Armillaria species are present in the forest stands of Ukraine: A. borealis, A. cepistipes, A. ostoyae, A. mellea, A. gallica and A. tabescens.