Клонування та аналіз послідовностей геномної рнк вірусу опіку гречки

Abstract

Было проведено клонирование последовательностей геномной РНК вируса ожога гречки. Анализ аминокислотных последовательностей секвенированых фрагментов показал, что клоны pВОГ.47 и pВОГ.62 имели наивысшую гомологию к РНК-полимеразе рабдовирусов (32–36%), а для клонов pВОГ.51, pВОГ.71, pВОГ.83 отмечалась гомология к гликопротеину и нуклеокапсидным белкам рабдовирусов. Покрытие соответствующих участков составляло около 60%.Було проведено клонування послідовностей геномної РНК вірусу опіку гречки. Аналіз амінокислотних послідовностей секвенованих фрагментів показав, що клони pВОГ.47 та pВОГ.62 мали найвищу подібність до РНК-полімерази рабдовірусів (32– 36%), а для клонів pВОГ.51, pВОГ.71, pВОГ.83 відмічалась подібність до глікопротеїну та нуклеокапсидним білкам рабдовірусів. Покриття подібних ділянок становило близько 60%.Genomic RNA sequences of virus burn of buckwheat have been cloned. Amino acid sequence analysis of studied fragments showed the highest identity to rhabdoviral RNApolymerase (32–36%) for clones pVBB.47 and pVBB.62, while for clones pVBB.51, pVBB.71, pVBB.83 the similarity to rhabdoviral glycoprotein and nucleocapsid proteins was noticed. The coverage of homologous regions made out approximately 60%.