QSPR-анализ реакционной способности субстратов тирозиназы методом случайного леса

Abstract

За допомогою видiленого частково очищеного препарату тирозинази в розроблених умовах здiйснено окиснення широкого спектра фенольних сполук з рiзним ступенем бiоконверсiї. Для вивчення зв’язку структура властивiсть був використаний метод випадкового лiсу; отримано адекватну консенсусну модель з 16%-ю помилкою внутрiшньої тестової виборки. Показано, що найбiльш значущим фактором у процесi бiоконверсiї фенолiв є геометричнi параметри молекули фенолу (~ 70%). Дипольний момент, лiпофiльнiсть i електронна поляризовнiсть молекул вiдiграють менш важливу роль (15, 7 i 6% вiдповiдно).With a help of isolated and partially purified tyrosinase preparation under the conditions developed, the oxidation of a wide range of phenolic compounds with different degrees of bioconversion is conducted. For the investigation of the structure property relationship, the method of random forest is used; an adequate consensus model is obtained. It predicts the out-of-bag set with only 16% of misclassification errors. It is shown that the most significant factor in the bioconversion of phenols is the geometric characteristics of phenol’s molecule (~ 70%). The dipole moment, lipophilicity, and electronic polarizability of a molecule plays a less significant role (15, 7, and 6%, respectively).