Візуалізація РНК-транскриптів за допомогою атомно-силової мікроскопії

Abstract

Посредством атомно-силовой микроскопии (АСМ) визуализированы РНК-транскрипты после проведения транскрипции с Т7 РНК-полимеразой in vitro. В качестве матрицы для транскрипции использовали фрагмент линеаризованной ДНК pGEMEX длиной 1414 пар нуклеотидов, содержащий промотор и область терминации транскрипции бактериофага Т7. РНК-транскрипты, иммобилизованные на слюде (субстрате для АСМ), образуют жгутоподобные конденсированные структуры длиной 122 ± 10 нм с характерным соотношением длины и ширины 4,5–5. Обсуждаются особенности иммобилизации молекул РНК на слюде для их последующей визуализации с помощью АСМ.