Биоинформационный поиск растительных протеинкиназ, участвующих в фосфорилировании белков микротрубочек и регуляции деления клеток

Abstract

Выполнен биоинформационный поиск растительных гомологов протеинкиназ SLK, PAK6, PAK7, MARK1, MAST2, TTBK1, TTBK2, AURKA, PLK1, PLK2 и PASK человека (Homo sapiens), участвующих в фосфорилировании белков микротрубочек и регуляции деления клеток. Показано наличие у растений гомологов протеинкиназ SLK, MAST2 и AURKA. Определено, что ближайшим гомологом протеинкиназы AURKA человека является белок с неизвестной функцией A7PY12_VITVI (STALK – SerineThreonine Aurora Like Kinase) из винограда (Vitis vinifera). Выполнены реконструкция и анализ пространственной структуры белка STALK, подтвердившие его принадлежность к группе AURKA-подобных протеинкиназ.Виконано біоінформаційний пошук рослинних гомологів протеїнкіназ SLK, PAK6, PAK7, MARK1, MAST2, TTBK1, TTBK2, AURKA, PLK1, PLK2 і PASK людини, які беруть участь у фосфорилюванні білків мікротрубочок та регуляції поділу клітин. Показана наявність у рослин гомологів протеїнкіназ SLK, MAST2 і AURKA. Визначено, що найближчим гомологом протеїнкінази AURKA людини є білок з невідомою функцією A7PY12_VITVI (STALK – Serine-Threonine Aurora-Like Kinase) з винограду (Vitis vinifera). Проведено реконструкцію і аналіз просторової структури білка STALK, що підтвердили його приналежність до групи AURKA-подібних протеїнкіназ.Bioinformatic search of plant homologues of human protein kinases SLK, PAK6, PAK7, MARK1, MAST2, TTBK1, TTBK2, AURKA, PLK1, PLK2 and PASK participating in microtubular protein phosphorylation and cell division regulation is carried out. The homologues of protein kinases SLK, MAST2 and AURKA were identified. It is found that closest homologue of human AURKA protein kinase is a protein with unknown function A7PY12_VITVI (STALK – Serine-Threonine Aurora-Like Kinase) from grape (Vitis vinifera). Reconstruction and analysis of threedimensional structure of STALK protein confirmed its relation to the group of AURKA like protein kinases.