Interaction of cyanine dyes with nucleic acids. 4. Efficient 5-fluorescent labelling of oligonucleotides with monomethyne pyrylium cyanine dye, Cyan 39

Abstract

A new system for fluorescent 5'-end labelling of oligonucleotides with cyanine dyes is proposed. Reaction of primary amine with pyrylium salt was used for the efficient conjugation of monomethyne pyrylium cyanine dye with 5'-aminoalkyl oligonucleotide with simultaneous conversion of the «brightless» pyrylium dye Cyan 39 into «bright» pyridinium one Cyan 40.Запропоновано новий підхід для флюоресцентного мічення олігонуклеотидів монометиновими пірилієвими барвниками. Реакція пірилісвих солей з первинними амінами була використана для кон'югації ціанінових барвників з 5'-алкіламіно-олігонуклеотидами і перетворення нефлюоресцентного пірилієвого барвника у флюоресцентний піридинісвий – Cyan 40.Предложен новый подход для флюоресцентного мечения олигонуклсотидов монометиновыми пирилиевыми красителями. Реакция пирилиевых солей с первичными аминами была использована для конъюгации цианиновых красителей с 5'-алкилами-ноолигонуклеотидами и превращения нефлюоресцентного пирилиевого красителя во флюоресцентный пиридиниевый – Cyan 40.