Біоінформатичний аналіз вторинної структури тринскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи

Abstract

Цель. Анализ вторичной структуры транскриптов интрона 1 гена whp1 кукурузы. Методы. Выравнивание, фолдинг in silico. Результаты. Найдены сложные микросателлиты. Исследована вторичная структура 74 транскриптов интрона 1 гена whp1. Выводы. Сделано предположение о влиянии транскриптов интрона 1 гена whp1 на восстановление фертильности кукурузы с S-типом цитоплазматической мужской стерильности. Ключевые слова: биоинформатика, ген whp1, ЦМС, кукуруза, интрон, вторичная структура.Мета. Аналіз вторинної структури транскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи. Методи. Вирівнювання, фолдинг in silico. Результати. Знайдено складні мікросателіти. Досліджено вторинну структуру 74 транскриптів інтрона 1 гена whp1. Висновки. Зроблено припущення щодо впливу транскриптів інтрона 1 гена whp1 на відновлення фертильності кукурудзи з S-типом цитоплазматичної чоловічої стерильності. Ключові слова: біоінформатика, ген whp1, ЦЧС, кукурудза, інтрон, вторинна структура.Aim. Analysis of the secondary structure of maize whp1 gene intron 1 transcripts. Methods. Alignment, in silico folding. Results. Novel complex microsatellites of the whp1 gene were discovered. 74 whp1 intron 1 transcripts secondary structures were predicted. Conclusions. The influence of whp1 gene intron 1 transcripts on restoration of CMS- S sterile maize fertility has been proposed. Keywords: bioinformatics, whp1 gene, CMS, maize, intron, secondary structure.