Комп’ютерне моделювання взаємодії калікс[4]арену С-99 із субфрагментом-1 міозину міометрія

Abstract

Проведене комп’ютерне моделювання взаємодії калікс[4]арену С-99 із субстратзв’язувальним центром функціонально активної ділянки субфрагмента-1 міозину міометрія. Показано, що у разі використання методології молекулярного докінгу можливе моделювання ліганд-рецепторних комплексів з геометрією, узгодженою з експериментальними даними. Вивчено взаємний вплив АТ Р та калікс[4]арену С-99 на їхню орієнтацію у лігандзв’язувальному центрі субфрагмента-1 міозину міометрія.В данной работе осуществлено компьютерное моделирование взаимодействия каликс[4]арена С-99 с субстратсвязывающим центром функционально активного участка субфрагмента-1 миозина миометрия. Показано, что при использовании методологии молекулярного докинга возможно моделирование лигандрецепторных комплексов, которые имеют геометрию, согласованную с экспериментальными данными. Изучено взаимное влияние АТР и каликс[4]арена С-99 на их ориентацию в лигандсвязывающем центре субфрагмента-1 миозина миометрия.In this work the computer design of interaction of calix[4]aren C-99 with a substrate-binding center of a functionally active area of a subfragment-1 myosin of the myometrium is carried out. It is shown when using methodology of molecular docking the receipt of ligand-receptor complexes which have geometry concerted with experimental data is possible. The cross-coupling of АТР and calix[4]aren C-99 on their orientation in ligandbinding center of subfragment-1 myosin of myometrium has been studied.