Влияние органических растворителей и доксорубицина на кластеризацию воды, связанной ДНК

Abstract

Показано, что вода в ДНК находится в нескольких кластерных состояниях, соответствующих сильноассоциированной (SAW), двум типам слабоассоциированной (WAW) и кристаллизационной воде, связанной с основными центрами. Слабополярная среда хлороформа стабилизирует слабоассоциированные формы воды, в то время как добавки полярного ДМСО препятствуют формированию одного из типов WAW. Интеркалирование гидратированных молекул ДНК доксорубицином уменьшает количество WAW и увеличивает количество SAW.Показано, що вода, зв’язана молекулами ДНК, перебуває у вигляді кластерів, які відповідають, сильноасоційованій воді (SAW), двом типам слабоасоційрованой (WAW) а також кристалізаційній воді, зв’язаної з основними центрами. Слабополярне середовище хлороформу стабілізує слабоасоційовані форми води, в той час як добавки полярного ДМСО перешкоджають формуванню одного з типів WAW. Інтеркалювання гідратованих молекул ДНК доксорубіцином зменшує кількість WAW і збільшує кількість SAW.Water bounded by DNA molecules is in several states corresponding to strongly associated water (SAW), two types of weakly associated water (WAW) and crystallizing water bound to basic sites. Weakly polar chloroform medium stabilizes the forms of weakly associated water but addition of polar DMSO inhibits the formation of one of WAWs. Intercalation of hydrated DNA molecules by doxorubicin diminishes the amounts of WAW and enhances of SAW contribution.