Исследование самоассоциации молекул некомплементарных дезокситетрануклеотидов различной последовательности оснований в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии

Abstract

Изучена самоассоциация молекул некомплементарных дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатов5' -d( CGAA), 5'-d(AAGC), 5'-d(CTGA) u5'-d(GAAG) вводном растворе методом одномерной и двухмерной ЯМР- ¹Н спектроскопии (500 и 600 МГц). Двухмерная гомоядерная ПМР-спектроскопия 2M-TOCSY и 2М-NOESY использованадля полного отнесения сигналов протонов тетрануклеотидов. Измерены концентрационные и температурные зависимости химических сдвигов необменивающихся протонов молекул. Экспериментальные результаты проанализированы на основе димерной модели ассоциации молекул. Определены равновесные константы димеризации, значения предельных химических сдвигов протонов тетрануклеотидов в мономере иассоциате, термодинамические параметры реакции ΔH и ΔS. Проведен сравнительный анализ характеристик самоассоциации некомплементарных дезокситетрануклеотидов различного состава и последовательности оснований в цепи.

Вивчено самоасоціацію молекул некомплементарних дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатів 5'-d(CGAA), 5'-d(AAGC), 5'-d(CTGA) і 5'-d(GAAG) у водному розчині методом одномірної та двомірної ¹Н-ЯМР-спектроскопії (500 і 600 МГц). Двомірну гомоядерну ПМР-спектроскопію 2M-NOESY використано для повного віднесення сигналів протонів тетрануклеотидів. Виміряно концентраційні і температурні залежності хімічних зсувів необмінюваних протонів молекул. Експериментальні результати проаналізовано на основі димерної моделі асоціації молекул. Визначено рівноважні константи димеризації, значення граничних хімічних зсувів протонів тетрануклеотидів у мономері та асоціаті, термодинамічні параметри реакції ΔН і ΔS. Здійснено порівняльний аналіз характеристик самоасоціації некомплементарних дезокситетрануклеотидів різного складу та послідовності основ у ланцюгу.

Self-association of deoxytetraribonucleosidetriphosphates 5'-d(CGAA), S'-d(AAGC), S'-(CTGA), 5'-d(GAAG) in aqueous solution have been studied by one-dimensional and two-dimensional ¹H-NMR spectroscopy (500 and 600 MHz). Two-dimensional homowdear PMR spectroscopy (2D-TOCSYand 2D-NOESY) was used for complete assignments of tetranucleotides proton signals. Concentration and temperature dependences of non-exchangeable proton chemical shifts have been measured. Experimental results have been analyzed using dimer model of molecules association. Equilibrium association constants, values of limiting proton chemical shifts of tetranucleotides in the monomer and dimer states, ther-modynamic parameters ΔH, AΔS of the reaction of molecules dimerization have been determined. Comparative analysis of the self-association characteristics for non-complementary deoxytetranucleotides of different base sequences has been made.