Синтез та вивчення антисенсових олігонуклеотидів, модифікованих імідазофеназиновими нуклеозидами

Abstract

Н-фосфонатним твердофазным методом отримано модифіковані імідазофеназиновими нуклеози­дами по 3'-, 5'- та внутрішніх положеннях олігонуклеотиди, комплементарні до ділянок рибосомного оперона, 16S рРНК мікоплазм та Escherichia coli. Показано, шр нуклеозиди імідазо[4,5-b]феназину та його 2-метального аналога, діючи як ефективні інтеркалятори, суттєво впливають на стабільність комплементарних дуплексів і тим самим підвищують антисенсову активність модифікованих олігонуклеотидних послідовностей.

Н-фосфонатным твердофазным методом получены модифи­цированные имидазофеназиновыми нуклеозидами по 3'-, 5'- и внутренним положениям олигонуклеотиды, комплементарные участкам рибосомного оперона, 16S рРНК микоплазм и Es­cherichia coli. Показано, что нуклеозиды имидазо[4,5-b]феназина и его 2-метильного аналога, действуя как эффективные интеркаляторы, существенно влияют на стабильность комп­лементарных дуплексов, повышая тем самым антисмысловую активность модифицированных олигонуклеотидных последова­тельностей.

Oligonucleotides containing imidazophenazine nucleosides at 3'-, 5'-and internal positions, which are complementary to certain regions of ribosomal operon DNA and I6S rRNA of mycoplasmas and E. coli, have been synthesized by H-phosphonate solid phase method. It has been shown that nucleosides of imidazol [4,5-b]phenazine and its 2-methyl analog as efficient intercalating agents strongly affect the stability of complementary complexes increasing the antisense activity of modified otigonucleotide sequence.