Взаимодействие флюоресцентных аналогов АТР и тРНК с фенилаланил-тРНК синтетазой

Abstract

Изучена модификация фенилаланил-тРНК синтетазы из Escherichia coli, штамм MRE-600, с помощью 1N⁶-этеноаденозин-5'-трифосфата (εАТР) в присутствии различных лигандов. Предполагается, что ковалентное присоединение εАТР происходит в области связывания 3'-конца тРНК. Получены флюоресцентные производные тРНКPhe, содержащие этено-аденозин в 3'-концевой АССА-последовательности, и исследовано их взаимодействие с фенилаланил-тРНК синтетазой.

Вивчено модифікацію фенілаланіл-тРНК синтетази з Escherichia coli, штам MRE-600, за допомогою 1N⁶-етеноаденозин-5'-трифосфату (εАТР) за присутності різних лігандів. Передбачається, що ковалентне приєднання εАТР відбувається в області зв’язування 3'-кінця тРНК. Отримано флуоресцентні похідні тРНКPhe, що містять етеноаденозин у 3'-кінцевий АССА-послідовності, і досліджено їхню взаємодію з фенілаланіл-тРНК синтетазою.

Affinity modification of E. coli MRE-600 phenylalanyl-tRNA synthetase by 1,N⁶-etheno-adenosine-5-triphosphate (εATP) in the presence of different ligands has been investigated. ATP conversion into εATP results in the disturbance of specific contacts of nucle-otide with the ATP binding site in the enzyme. The εATP covalent attachment site is assumed To be situated in the tRNA 3'-terminus recognizing site. Fluorescent tRNAPhe analogs have been prepared by replacing adenosine 73 or 76 by 1,N⁶-ethenoadenosine. The activity of these analogs has been investigated in the aminoacylation. The low yield of photoinduced covalent attachment of these derivatives to phenylalanyl-tRNA synthetase is observed.