Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження
dc.contributor.author | Глушенков, А.М. | |
dc.contributor.author | Говорун, Д.М. | |
dc.date.accessioned | 2016-04-22T18:36:16Z | |
dc.date.available | 2016-04-22T18:36:16Z | |
dc.date.issued | 2016 | |
dc.description.abstract | Вперше на рiвнi квантово-механiчної теорiї MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311++G(d,p) у вакуумному наближеннi отримано повне сiмейство H-зв’язаних гомоасоцiатiв m⁹Gua·m⁹Gua, яке складається з 57 структур, вiдносна енергiя Гiббса яких знаходиться в дiапазонi 0–17,69 ккал/моль за нормальних умов. Гомоасоцiати стабiлiзуються класичними (NH…N, NH…O, OH…N, OH...O), слабкими (CH...N, CH...O) H-зв’язками, а також ван-дер-ваальсовими контактами. Iз зафiксованих гомоасоцiатiв 11 структур є плоскосиметричними (3 з яких центросиметричнi), 7 структур U-подiбнi, 12 структур мають Г-подiбну неканонiчну геометрiю, 2 структури мають Т-подiбну геометрiю, 20 структур спiралеподiбнi, 3 структури хрестоподiбнi та 2 iстотно непланарнi. Доведено, що метильна група m⁹Gua є донором Н-зв’язування та впливає на енергетичний розподiл гомоасоцiатiв. Показано, що при самоасоцiацiї m⁹Gua його амiногрупа може бути одночасно як донором, так i акцептором H-зв’язку. Встановлено лiнiйну залежнiсть мiж енергiєю H-зв’язкiв CH...O=N та значенням електронної густини у вiдповiдних критичних точках. | uk_UA |
dc.description.abstract | Впервые на уровне квантово-механической теории MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311+ +G(d,p) в вакуумном приближении получено полное семейство H-связанных гомоассоциатов m⁹Gua·m⁹Gua, состоящее из 57 структур, относительная энергия Гиббса которых находится в диапазоне 0–17,69 ккал/моль при нормальных условиях. Гомоассоциаты стабилизируются классическими (NH...N, NH...O, OH...N, OH...O), слабыми (CH...N, CH...O) H-связями, а также ван-дер-ваальсовыми контактами. Из зафиксированных гомоассоциа- тов 11 структур являются плоскосимметричными (3 из которых центросимметричны), 7 структур U-образные, 12 структур имеют Г-образную неканоническую геометрию, 2 структуры обладают Т-образной геометрией, 20 структур винтовые, 3 структуры крестообразные и 2 структуры существенно непланарные. Доказано, что метильная группа m⁹Gua является донором H-связывания и влияет на энергетическое распределение гомоассоциатов. Показано, что при самоассоциации m⁹Gua аминогруппа может быть одновременно как донором, так и акцептором H-связи. Установлена линейная зависимость между энергией CH...O=N H-связей и значением электронной плотности в соответствующих критических точках. | uk_UA |
dc.description.abstract | For the first time on the MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311++G(d,p) theory level, the complete family of m⁹Gua·m⁹Gua homoassociates in vacuum, which consists of 57 structures the interval 0–17.69 kcal/mol of relative Gibbs free energies under standard conditions, is obtained. Homoassociates are stabilized through classical (NH...N, NH...O, OH...N, OH...O) and weak (CH...N, CH...O) H-bonds, and van-der-Waals contacts. The structures of 11 m9Gua·m9Gua homoassociates are planar (3 of them are centrosymmetric), 7 structures are U-shaped, 12 structures have L-shaped noncanonical geometry, 2 structures have T-shaped geometry, 20 structures — spiral, 3 — cross shaped, 2 — significantly non-planar. It is proved that the methyl group of m⁹Gua in position 9 is a donor of H-bonding and influences the energy distribution of homoassociates. It is demonstrated that, during the self-association of m⁹Gua, its amino-group can be simultaneously a donor and an acceptor of an H-bond. A linear relation between the energy of CH...O=N H-bonds and their electron density in corresponding critical bonds is established. | uk_UA |
dc.identifier.citation | Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження / А.М. Глушенков, Д.М. Говорун // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. — 2016. — № 3. — С. 98-106. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. | uk_UA |
dc.identifier.issn | 1025-6415 | |
dc.identifier.udc | 577.332 | |
dc.identifier.uri | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/99071 | |
dc.language.iso | uk | uk_UA |
dc.publisher | Видавничий дім "Академперіодика" НАН України | uk_UA |
dc.relation.ispartof | Доповіді НАН України | |
dc.status | published earlier | uk_UA |
dc.subject | Біофізика | uk_UA |
dc.title | Повна множина Н-зв’язаних гомоасоцiатiв 9-метилгуанiну за участю мутагенних таутомерiв: квантово-механiчне дослiдження | uk_UA |
dc.title.alternative | Полное множество Н-связанных гомоассоциатов 9-метилгуанина с участием мутагенных таутомеров: квантово-механическое исследование | uk_UA |
dc.title.alternative | Complete set of H-bonded homoassociates of 9-methylguanine with participation of mutagenic tautomers: quantum-mechanical study | uk_UA |
dc.type | Article | uk_UA |
Файли
Оригінальний контейнер
1 - 1 з 1
Завантаження...
- Назва:
- 14-Glushenkov.pdf
- Розмір:
- 487.04 KB
- Формат:
- Adobe Portable Document Format
Контейнер ліцензії
1 - 1 з 1
Завантаження...
- Назва:
- license.txt
- Розмір:
- 817 B
- Формат:
- Item-specific license agreed upon to submission
- Опис: