Дезоксирибоаналог антикодоновой ветви дрожжевой тPHKPhe не способен к кодон-зависимому связыванию с малыми субчастицами рибосом Escherichia coli и печени кролика

Abstract

Для изучения влияния модификаций сахарофосфатного остова антикодоновой области тРНК на ее взаимодействие с рибосомами использован олигонуклеотид d (CCAGACTGAAGATCTGG), соответствующий по нуклеотидной последовательности немодифицированной антикодоновой ветви дрожжевой tPHKPhe Показано, что данный олигонуклеотид в растворе образует внутримолекулярную «шпильку», однако не способен связываться с 30S и 40S субчастицами рибосом Е. coli и печени кролика соответственно в присутствии рибо-(поли (U)) и дезоксирибо-(поли (dT)) матриц. Добавление антибиотика неомицина В не меняло ситуации.

Для вивчення впливу модифікацій сахарофосфатного остова антикодонової області тРНК на її взаємодію з рибосомами використано олігонуклеотид d(CCAGACTGAAGATCTGG), який за нуклеотидною послідовністю відповідає немодифікованій антикодоновій гілці дріжджової тPHKPhe. Показано, що даний олігонуклеотид у розчині утворює внутрішньомолекулярну «шпильку», проте не здатний зв’язуватися з 30S і 40S субчастинками рибосом Е. coli і печінки кроля відповідно за присутності рибо-(полі (U)) і дезоксирибо-(полі (dT)) матриць. Додавання антибіотика неоміцину В не змінювало ситуації.

Oligonucleotide d(CCAGACTGAAGATCTGG) has been used to study influence of sugar-phosphate backbone modifications on the interaction of tRNA anticodon region with ribosomes. Its sequence corresponds to nonmodified tRNAPheyeast anticodon arm. The oligonucleotide is shown to form an intramolecular «loop», but nevertheless it is not able to be bound to 305 and 40S ribosomes of E. coli and rabbit liver in the presence of ribo-(poly(U)) or deoxyribo-(poly(dT)) messenger. The addition of neomycin B promotes no changes in the situation.