Аллельные варианты гена bamy1 ячменя в восточноевропейской и центральноазиатской зонах

Abstract

Приведены результаты анализа распределения аллелей bamy1 у сортов ярового ячменя, районированных на территории восточноевропейской и центральноазиатской географических зон. Распространение аллелей гена bamy1 в различных агроклиматических условиях Евро-Азиатского региона определяли с помощью EPIC (Exon-Primed Intron-Crossing) ПЦР-анализа. Сконструированы EPIC-праймеры, комплементарные консервативным участкам генов эндоспермальной и общей β-амилаз. Изучение исходного материала коллекции ярового ячменя позволило дифференцировать сорта по наличию 126 п.н. вставки интрона 3 гена bamy1, которую связывают с низкоактивной β-амилазой. По-лученные данные свидетельствуют о низком уровне варьирования гена bamy1 культурного ячменя, а также показывают географическое распределение аллелей.

За допомогою сконструйованих екзон-специфічних EPIC-праймерів, комплементарних консервативним ділянкам генів ендоспермальної і загальної β-амілаз, вивчали матеріал колекції сортів ярого ячменю, районованих на території східноєвропейських та центральноазіатських зон. Це дозволило диференціювати даний матеріал за наявністю 126 п.н. вставки інтрона 3 гена bamy1, яку пов’язують з низькоактивною β-амілазою. Отримані дані свідчать про низький рівень варіювання гена bamy1 культурного ячменю, а також показують географічний розподіл алелів.

Collections of varieties of spring barley cultivars from Eastern European and Central Asian areas were analyzed by exon-specific PCR (EPIC) for β-amylase genes. The endosperm β-amylase gene (bamy1) was differentiated by the presence of 126 bp MITE insertion into intron 3, which is associated with low activity β-amylase. The findings suggest that a low level of genetic variation for bamy1 gene within climatic zones is associated with individual breeding program for each climatic zone.