Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов
dc.contributor.author | Демчук, О.Н. | |
dc.contributor.author | Карпов, П.А. | |
dc.contributor.author | Блюм, Я.Б. | |
dc.date.accessioned | 2017-11-24T16:24:50Z | |
dc.date.available | 2017-11-24T16:24:50Z | |
dc.date.issued | 2012 | |
dc.description.abstract | Приведен обзор и анализ возможностей применения технологии CUDA для ускорения расчетов в области структурной биологии и биоинформатики. На примере работы с программой HEX 6.1 выполнен сравнительный анализ прироста производительности и качества результатов жесткого докинга низкомолекулярных соединений различных классов на поверхности FtsZ белка из Arabidopsis thaliana. Идентифицировано несколько потенциальных сайтов связывания бензимидазолов с растительным FtsZ. | uk_UA |
dc.description.abstract | Наводиться огляд та аналіз можливостей застосування технології CUDA для прискорення обчислень в галузі структурної біології та біоінформатики. На прикладі роботи з програмою Hex 6.1 здійснено порівняльний аналіз приросту продуктивності та якості результатів жорсткого докінгу низькомолекулярних сполук різних класів на поверхні FtsZ-білка із Arabidopsis thaliana. Ідентифіковано декілька потенційних сайтів зв’язування бензімідазолів із рослинним FtsZ. | uk_UA |
dc.description.abstract | The opportunities to apply the CUDA technology for faster computations in structural biology and bioinformatics are reviewed and analyzed. Using HEX 6.1 software, we performed a comparative analysis of the efficiency and the increase in quality after CUDA application. The work was conducted on the example of rigid docking of low-molecular-weight compounds of different classes on the surface of the Arabidopsis thaliana FtsZ. Several potential binding sites of benzimidazoles to the plant FtsZ were identified. | uk_UA |
dc.identifier.citation | Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов / О.Н. Демчук, П.А. Карпов, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 3. — С. 55-64. — Бібліогр.: 54 назв. — рос. | uk_UA |
dc.identifier.issn | 0564-3783 | |
dc.identifier.other | DOI: 10.3103/S0095452712030048 | |
dc.identifier.udc | 577.112.7(577.332+004.42) | |
dc.identifier.uri | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126471 | |
dc.language.iso | ru | uk_UA |
dc.publisher | Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України | uk_UA |
dc.relation.ispartof | Цитология и генетика | |
dc.status | published earlier | uk_UA |
dc.subject | Оригинальные работы | uk_UA |
dc.title | Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов | uk_UA |
dc.title.alternative | Докінг низькомолекулярних лігандів на поверхні рослинного FtsZ білка: застосування технології cuda для прискорення обчислень | uk_UA |
dc.title.alternative | Docking small ligands to molecule of the plant FtsZ protein: Application of the CUDA technology for faster computations | uk_UA |
dc.type | Article | uk_UA |
Файли
Оригінальний контейнер
1 - 1 з 1
Завантаження...
- Назва:
- 07-Demchuk.pdf
- Розмір:
- 269.74 KB
- Формат:
- Adobe Portable Document Format
Контейнер ліцензії
1 - 1 з 1
Завантаження...
- Назва:
- license.txt
- Розмір:
- 817 B
- Формат:
- Item-specific license agreed upon to submission
- Опис: