Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов

dc.contributor.authorДемчук, О.Н.
dc.contributor.authorКарпов, П.А.
dc.contributor.authorБлюм, Я.Б.
dc.date.accessioned2017-11-24T16:24:50Z
dc.date.available2017-11-24T16:24:50Z
dc.date.issued2012
dc.description.abstractПриведен обзор и анализ возможностей применения технологии CUDA для ускорения расчетов в области структурной биологии и биоинформатики. На примере работы с программой HEX 6.1 выполнен сравнительный анализ прироста производительности и качества результатов жесткого докинга низкомолекулярных соединений различных классов на поверхности FtsZ белка из Arabidopsis thaliana. Идентифицировано несколько потенциальных сайтов связывания бензимидазолов с растительным FtsZ.uk_UA
dc.description.abstractНаводиться огляд та аналіз можливостей застосування технології CUDA для прискорення обчислень в галузі структурної біології та біоінформатики. На прикладі роботи з програмою Hex 6.1 здійснено порівняльний аналіз приросту продуктивності та якості результатів жорсткого докінгу низькомолекулярних сполук різних класів на поверхні FtsZ-білка із Arabidopsis thaliana. Ідентифіковано декілька потенційних сайтів зв’язування бензімідазолів із рослинним FtsZ.uk_UA
dc.description.abstractThe opportunities to apply the CUDA technology for faster computations in structural biology and bioinformatics are reviewed and analyzed. Using HEX 6.1 software, we performed a comparative analysis of the efficiency and the increase in quality after CUDA application. The work was conducted on the example of rigid docking of low-molecular-weight compounds of different classes on the surface of the Arabidopsis thaliana FtsZ. Several potential binding sites of benzimidazoles to the plant FtsZ were identified.uk_UA
dc.identifier.citationДокинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов / О.Н. Демчук, П.А. Карпов, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 3. — С. 55-64. — Бібліогр.: 54 назв. — рос.uk_UA
dc.identifier.issn0564-3783
dc.identifier.otherDOI: 10.3103/S0095452712030048
dc.identifier.udc577.112.7(577.332+004.42)
dc.identifier.urihttps://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126471
dc.language.isoruuk_UA
dc.publisherІнститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН Україниuk_UA
dc.relation.ispartofЦитология и генетика
dc.statuspublished earlieruk_UA
dc.subjectОригинальные работыuk_UA
dc.titleДокинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетовuk_UA
dc.title.alternativeДокінг низькомолекулярних лігандів на поверхні рослинного FtsZ білка: застосування технології cuda для прискорення обчисленьuk_UA
dc.title.alternativeDocking small ligands to molecule of the plant FtsZ protein: Application of the CUDA technology for faster computationsuk_UA
dc.typeArticleuk_UA

Файли

Оригінальний контейнер

Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Завантаження...
Ескіз
Назва:
07-Demchuk.pdf
Розмір:
269.74 KB
Формат:
Adobe Portable Document Format

Контейнер ліцензії

Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Завантаження...
Ескіз
Назва:
license.txt
Розмір:
817 B
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис: