Aberrant expression of metallothioneins in clear cell renal cell carcinomas

Abstract

Aim. To find candidate tumor suppressor genes among metallothioneins for clear cell renal cell carcinoma. Methods. Analysis of the microarray data, quantitative PCR. Results. We found three genes encoding metallothioneines that showed reduced expression in different types of renal tumors, using protocol of the cross-platform meta-analysis of microarray data with normalization on several reference genes. Decreased expression of the MT1G, MT1F, and MT1H genes in clear cell renal cell carcinoma was confirmed by qPCR. Conclusions. The MT1G, MT1F and MT1H genes as well as may be considered as the candidate tumor suppressor genes for ccRCC.

Мета. Пошук потенційних генів-супресорів серед металотіонеїнів при розвитку світло-клітинної карциноми нирок. Методи. Біоінформатичний аналіз баз даних мікрочіпів, кількісна ПЛР. Результати. Використовуючи біоінформатичні методи порівняння різних баз даних мікрочипів із застосуванням кросплатформенної нормалізації по декількох референтних генах, нами було знайдено три гени з родини металотіонеїнів, що показують знижену експресію у різних типах пухлин нирок. Зниження експресії генів МТ1G, MT1F та MT1H в зразках світлоклітинної карциноми нирок було продемонстровано методом кількісної ПЛР. Висновки. Гени МТ1G, MT1F та MT1H є потенційними супресорами росту пухлин нирок.

Цель. Поиск потенциальных генов-супрессоров светло-клеточной карциномы почек среди металлотионеинов. Методы. Анализ результатов микрочипов, выделение тотальной РНК, количественная ПЦР. Результаты. Используя метод сравнения результатов микрочипов с применением кроссплатформенной нормализации по нескольким референтным генам, нами были найдены три гена семейства металлотионеинов с пониженной экспрессией в различных типах опухолей почек. Снижение экспрессии генов МТ1G, MT1F и MT1H в светлоклеточной карциноме почек было продемонстрировано методом количественной ПЦР. Выводы. Гены МТ1G, MT1F и MT1H могут рассматриваться как потенциальные супрессоры роста опухолей почек.