Вивчення взаємодії проліл-тРНК синтетази Thermus thermophilus з гомологічною тРНКCGGPro методами хімічної модифікації в розчині

Abstract

Методами хроматографії виділено дві ізоакцепторні тРНКPro з T. thermophilus HB8 чистотою біля 95 і 97 % відповідно. Вивчено первинні структури тРНКСGGPro і тРНКGGGPro з T. thermophilus, які відрізняються між собою у 18 положеннях. Показано, що в розчині гомологічна прoліл-тРНК синтетаза захищає від алкілування етилнітрозосечовиною фосфати тРНКСGGPro, розташовані в D-стеблі (9, 10 і 13), на 5’-кінці антикодонового стебла (26, 27, 28 і 29), в антикодоновій петлі (34, 35, 37 і 38) і з 3’-боку акцепторного стебла (67, 68).

Two isoaccepting Thermus thermophilus HB8 tRNAPro were isolated by the chromatography methods with purity about 95 and 97 % . The primary structures of isoaccepting tRNAGGGPro and tRNACGGPro were studied by the gel-sequencing method, and differences between them were found in 18 positions. Our results show that in solution the gomologous prolyl-tRNA synthetase protects the phosphates allocated in D-stem (9, 10, 13), 5'-end of anticodon-stem (26–29), anticodon-loop (34, 35, 37–39) and acceptor-stem (67, 68) of tRNACGGPro from alkylation by ethylnitrosourea.

Методами хроматографии виделены две изоакцепторные тРНКPro из T. thermophilus HB8 чистотой около 95 и 97 % соответственно. Изучены первичные структуры тРНКСGGPro и тРНКGGGPro из T. thermophilus, отличающиеся между собой в 18 положениях. Показано, что в растворе гомологичная прoлил-тРНК синтетаза защищает от алкилирования этилнитрозомочевиной фосфаты тРНКСGGPro, расположенные в D-стебле (9, 10 і 13), на 5'-конце антикодонового стебля (26, 27, 28 и 29), в антикодоновой петле (34, 35, 37иі 38) и с 3'-стороны акцепторного стебля (67 и 68).